草鱼出血病是由草鱼呼肠孤病毒(grasscarpreovirus,GCRV)引起的、具有高度传染性与致死性的病毒性疾病。近年来经常可见因草鱼出血病暴发而导致大批草鱼死亡,给养殖户和当地政府造成巨大经济损失的报道。为了解不同区域内GCRV的分型分布情况,有效防控草鱼出血病,利用GenBank和实验室病毒序列信息,珠江水产研究所水产病害与免疫课题组提出了GCRV分为三个基因型的观点;建立了可同时检测不同基因型GCRV的三重PCR检测方法;针对主要流行基因II型GCRV,建立了可现场应用的RT-LAMP检测方法;为满足病毒定量需求,建立针对不同基因型的荧光定量PCR检测方法。本研究形成的GCRV诊断试剂盒,在全国7个省市地区进行了示范推广,检测样品超过份,获得了GCRV在调查区域的分型分布图。应用结果显示,草鱼呼肠孤病毒诊断试剂盒不但可以检测出草鱼呼肠孤病毒,还可以通过检测产物分辨出样品中存在的病毒基因类型。检测技术示范推广区域在使用草鱼出血病快速诊断试剂盒后,引种检测出GCRV阳性率2.15-10%,平均为4.76%;育成阶段检测出GCRV阳性率0.36-7%,平均为2.17%。在了解地区分型分布情况下,指导养殖户进行疫苗的选择和使用,尽可能避免引种和育成阶段带毒问题导致的草鱼出血病,降低发病引起的经济损失。技术推广区域内因草鱼出血病导致的死亡率同比下降4.8-10.2%,平均为6.92%。生产成本节约50-元/亩,技术应用农民收入间接增加约-元/亩,示范面积约2万亩,间接效益约万元,同时带来了可观的社会效益和生态效益。